Fuera de los minijuegos, el resto del juego es completamente libre para explorar, permitiéndote rastrear Hogwarts a tu voluntad y hacer campañas paralelas en orden aleatorio. El juego continúa la línea de la película, pero sus creadores dicen que tuvieron cuidado de no marear al jugador con diálogos y escenas cortadas. Por lo que, si los jugadores quieren indagar en la historia lo pueden hacer mediante conversaciones. O pueden también si quieren, hacer hechizos en estanterías o a los slytherins

Fuera de las batallas, las misiones sobre la historia del juego ofrecen una variedad de uso de ciertos eventos en la historia del film, como en especial las secciones de creaciones artísticas. Así como algo del Pensadero, donde Harry es enseñado por Dumbledore para ver las memorias de Voldemort, hay niveles point-and-click y niveles rápidos para jugar. Cuando Harry es perseguido por Mortífagos pasa a un nivel lineal, parecido al Time Crisis.